San Timoteo comenzó en 1939 con una pequeña comunidad de familias de la zona del Metro Norte que se reunían en la casa de Wally y Kay Sweet, donde el P. Joseph Lapinski, de la parroquia de la Inmaculada Concepción, acudía a oficiar la misa. En 1943, a medida que la comunidad crecía, comenzaron a celebrar la misa dominical en la escuela pública local. El 7 de mayo de 1944, el arzobispo John Murray consagró el primer templo. Tras el fin de la Segunda Guerra Mundial, la zona del norte metropolitano creció rápidamente. La comunidad se dio cuenta de que se necesitaba más espacio, por lo que en 1954 se adquirió la propiedad actual. Tras una exitosa campaña de recaudación de fondos, se construyó una escuela parroquial. En 1956, las Hermanas de San Francisco de Dubuque llegaron para formar parte del personal de la escuela. La escuela cerró en 1969, pero el compromiso de San Timoteo con la educación y la formación de personas de todas las edades continúa. La iglesia actual se construyó en 1965 y fue consagrada por el arzobispo Leo Binz el 23 de mayo de ese año. El interior ha sido remodelado varias veces. El santuario actual cuenta con un gran icono de un crucifijo que se instaló y consagró en febrero de 2024. También alberga una escultura de madera tallada a mano de San Timoteo.